Таргетное секвенирование гена LEP в различных этнических группах подростков с ожирением

Обложка

Цитировать

Полный текст

Открытый доступ Открытый доступ
Доступ закрыт Доступ предоставлен
Доступ закрыт Доступ платный или только для подписчиков

Аннотация

Ген, кодирующий лептин (LEP), иначе называют геном фактора ожирения. Показано, что полиморфные локусы и мутации в гене LEP могут вызывать нарушения обмена веществ и приводить к ожирению, а также развитию различных патологий, связанных с ожирением. Цель данного исследования – провести поиск полиморфных вариантов гена LEP в группах подростков с избыточной массой тела и/или ожирением в этнических выборках русских и бурят. В исследовании приняли участие 48 подростков от 11 до 17 лет (средний возраст 14,27 ±2,09 лет) с разным статусом веса: нормальной массой тела и избыточной массой тела и/или ожирением. Из них русских – 21, бурят – 27. Методы исследования включали: оценку клинического статуса и антропометрических показателей; полимеразную цепную реакцию (ПЦР) и секвенирование по методу Сэнгера фрагмента гена LEP; биоинформационный анализ; статистическую обработку полученных результатов. В исследовании были подобраны условия амплификации для фрагмента гена LEP общей протяженностью 3878 п. н. (128251456–128255334) и проведено его секвенирование. После биоинформатической обработки полученных результатов в исследованной группе подростков с разным статусом веса обнаружено десять SNP. Из них семь зарегистрированных в базе NCBI и три замены, ранее не зарегистрированных в NCBI. Из семи полиморфизмов, зарегистрированных в NCBI, два SNP идентифицированы во всех группах исследования, два SNP выявлены в основной группе, из них один в группе русских, один в группе бурят, а также три SNP обнаружены только в контрольной группе у подростков бурят. Три SNP, не зарегистрированные в NCBI, были идентифицированы только в группе подростков с избыточной массой тела и/или ожирением, в том числе два в группе русских – chr7:128255051 (G>C), chr7:128255092 (G>C), и один в группе бурят – chr7:128254681 (C>G). В исследовании охарактеризована частота SNP, идентифицированных в результате секвенирования фрагмента гена LEP в группах подростков с разным статусом веса.

Полный текст

Доступ закрыт

Об авторах

Е. В. Беляева

Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека

Автор, ответственный за переписку.
Email: belyeva_irk@mail.ru
Россия, Иркутск, 664003

Т. А. Баирова

Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека

Email: belyeva_irk@mail.ru
Россия, Иркутск, 664003

О. А. Ершова

Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека

Email: belyeva_irk@mail.ru
Россия, Иркутск, 664003

А. Ю. Самбялова

Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека

Email: belyeva_irk@mail.ru
Россия, Иркутск, 664003

В. В. Синьков

Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека

Email: belyeva_irk@mail.ru
Россия, Иркутск, 664003

В. В. Бальжиева

Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека

Email: belyeva_irk@mail.ru
Россия, Иркутск, 664003

Л. В. Рычкова

Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека

Email: belyeva_irk@mail.ru
Россия, Иркутск, 664003

Л. И. Колесникова

Научный центр проблем здоровья семьи и репродукции человека

Email: belyeva_irk@mail.ru
Россия, Иркутск, 664003

Список литературы

  1. Agrahari M. K., Mallik M., Sapkota K. et al. Abnormal high body mass index among adolescents of secondary schools // JNMA: J. Nepal Med. Ass. 2024. V. 62. № 269. P. 34–36. doi: 10.31729/jnma.8405
  2. Белькова Н. Л., Немченко У. М., Погодина А. В. и др. Особенности состава и структуры кишечного микробиома подростков с ожирением и разной продолжительностью грудного вскармливания // Бюл. эксперим. биол. и мед. 2019. Т. 167. № 6. С. 717–721. doi: 10.1007/s10517-019-04617-7
  3. Neri D., Martínez Steele E., Rauber F. et al. Infants’ dietary pattern characterized by ultraprocessed foods is associated with rapid weight gain and overweight/obesity risk: national health and nutrition examination survey 2009–2018 // J. Acad. of Nutrition and Dietetics. 2024. V. 24. P. 2212–2672. doi: 10.1016/j.jand.2024.02.003
  4. Егорова Э. С., Ахметов И. И. Генетические полиморфизмы, ассоциированные с эффективностью коррекции массы тела: систематический обзор // Генетика. 2023. Т. 59. № 8. С. 870–887. doi: 10.31857/S0016675823080052
  5. Nordang G. B. N., Busk O. L., Tveten K. Next-generation sequencing of the monogenic obesity genes LEP, LEPR, MC4R, PCSK1 and POMC in a Norwegian cohort of patients with morbid obesity and normal weight controls // Mol/. Genet. and Metabolism. 2017. V. 121. № 1. P. 51–56. doi: 10.1016/j.ymgme.2017.03.007
  6. Obradovic M., Sudar-Milovanovic E., Soskic S. et al. Leptin and obesity: Role and clinical implication. // Front Endocrinol (Lausanne). 2021. V. 12. P. 585887. doi: 10.3389/fendo.2021.585887
  7. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/gene/3952 (дата обращения 10.04.2024).
  8. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/snp/?LinkName=gene_snp&from_uid=3952 (дата обращения 10.04.2024).
  9. https://www.ncbi.nlm.nih.gov/clinvar (дата обращения 10.04.2024).
  10. Кочетова О. В., Викторова Т. В., Мустафина О. Е. и. др. Ассоциации полиморфных вариантов генов ADRA2А и ADRB3 с метаболическим синдромом у татар // Генетика. 2015. Т. 51. №7. С. 830. doi: 10.7868/S0016675815070061
  11. Трифонова Е. А., Попович А. А., Вагайцева К. В. и др. Метод мультиплексного генотипирования полиморфных вариантов генов, ассоциированных с ожирением и индексом массы тела // Генетика. 2019. Т. 55. № 10. С. 1218–1230. doi: 10.1134/S001667581910014X
  12. Raskiliene A., Smalinskiene A., Kriaucioniene V. et al. Associations of MC4R, LEP, and LEPR polymorphisms with obesity-related parameters in childhood and adulthood // Genes (Basel). 2021. V. 12. № 6. doi: 10.3390/genes12060949
  13. Иевлева К. Д., Баирова Т. А., Шенеман Е. А. и др. Вклад носительства полиморфных локусов генов энергетического обмена в метаболические нарушения у подростков двух этнических групп с избыточной массой тела // Бюл. эксперим. биол. и мед. 2021. Т. 172. № 10. С. 440-444. doi: 10.47056/0365-9615-2021-172-10-440-444
  14. Кочетова О. В., Шангареева З. А., Викторова Т. В. и др. Ассоциация вариантов генов LEP rs2167270, LEPR rs1137100, GHRL rs696217, rs27647 и NPY rs16147 с ожирением и пищевым поведением подростков: исследование «случай–контроль» // Вопросы современной педиатрии. 2022. Т. 21. № 3. С. 242–252. doi: 10.15690/vsp.v21i3.2428
  15. Valladares M., Obregón A. M., Weisstaub G. et al. Association between feeding behavior, and genetic polymorphism of leptin and its receptor in obese Chilean children // Nutricion Hospitalaria. 2015. V. 31. № 3. P. 1044–1051. doi: 10.3305/nh.2015.31.3.8049
  16. Баирова Т. А., Бальжиева В. В., Аюрова Ж. Г. и др. Соотношение талии к росту – важный антропометрический дискриминатор метаболических нарушений у подростков с избыточной массой тела и ожирением: пилотное исследование // Педиатрия. Журн. им. Г.Н. Сперанского. 2022. Т. 101. № 5. С. 32–42. doi: 10.24110/0031-403X-2022-101-5-32-42
  17. Баирова Т. А., Ершова О. А., Самбялова А. Ю. и др. Секвенирование фрагмента гена лептина у подростков с разным статусом веса // Acta Biomedica Scientifica. 2023. Т. 8. № 4. С. 92–100. doi: 10.29413/ABS.2023-8.4.10
  18. Новикова Е. А., Рычкова Л. В., Погодина А. В. и др. Ожирение у подростков, рожденных путем кесарева сечения. Вопросы детской диетологии. 2021. Т. 19. № 6. С. 26–33. doi: 10.20953/1727-5784-2021-6-26-33
  19. Бочарова О. В., Теплякова Е. Д. Ожирение у детей и подростков — проблема здравоохранения XXI в. // Казанский мед. журн. 2020. Т. 101. № 3. С. 381–388. doi: 10.17816/KMJ2020-381
  20. Labayen I., Ruiz J. R., Moreno L. A. et al. The effect of ponderal index at birth on the relationships between common LEP and LEPR polymorphisms and adiposity in adolescents // Obesity (Silver Spring, Md.). 2011. V. 19. № 10. P. 2038–2045. doi: 10.1038/oby.2011.74
  21. Brandl E. J., Frydrychowicz C., Tiwari A. K. et al. Association study of polymorphisms in leptin and leptin receptor genes with antipsychotic-induced body weight gain // Progress in Neuro-Psychopharmacology & Biological Psychiatry. 2012. V. 38. № 2. P. 134–141. doi: 10.1016/j.pnpbp.2012.03.001
  22. Boiko A. S., Pozhidaev I. V., Paderina, D. Z. et al. Gene polymorphisms of hormonal regulators of metabolism in patients with schizophrenia with metabolic syndrome // Genes. 2022. V. 13. № 5. doi: 10.3390/genes13050844
  23. Salerno P. S. V., Bastos C. R., Peres A. et al. Leptin polymorphism rs3828942: Risk for anxiety disorders? // European Archives of Psychiatry and Clinical Neuroscience. 2021. V. 271. P. 1141–1148. doi: 10.1007/s00406-019-01051-8
  24. Aouizerat B. E., Byun E., Pullinger C. R. et al. Sleep disruption and duration are associated with variants in genes involved in energy homeostasis in adults with HIV/AIDS // Sleep Medicine. 2021. V. 82. P. 84–95. doi: 10.1016/j.sleep.2020.08.028

Дополнительные файлы

Доп. файлы
Действие
1. JATS XML
Скачать

© Российская академия наук, 2024