Отправить статью по E-mail 
Транскриптомные сдвиги в мультипотентных мезенхимальных стромальных клетках при моделировании эффектов микрогравитации
- Авторы: Якубец Д.А.1, Буравкова Л.Б.1
-
Учреждения:
- ФГБУН Государственный научный центр Российской Федерации – Институт медико-биологических проблем Российской академии наук
- Выпуск: Том 520, № 1 (2025)
- Страницы: 95-99
- Раздел: Статьи
- URL: https://cardiosomatics.ru/2686-7389/article/view/682050
- DOI: https://doi.org/10.31857/S2686738925010159
- EDN: https://elibrary.ru/tchpes
- ID: 682050
Цитировать
Полный текст
Открытый доступ
Доступ предоставлен
Доступ платный или только для подписчиков
Аннотация
Одним из наиболее явных проявлений негативного воздействия факторов космического полета на организм космонавтов является остеопения. С активным развитием пилотируемых космических полетов и увеличением продолжительности пребывания космонавтов в условиях невесомости растет необходимость понимания механизмов изменений, происходящих на уровне мультипотентных мезенхимальных стромальных клеток, участвующих в ремоделировании костной ткани. С помощью метода РНК-секвенирования изучали изменения транскриптомного профиля ММСК после 5-суточного моделирования эффектов микрогравитации. Обнаружено выраженное снижение экспрессии группы генов, продукты которых задействованы в процессах, связанных с пролиферацией клеток, в частности, в митотической фазе клеточного цикла. Сдвиги транскрипционного профиля ММСК были подтверждены подсчетом веретен деления и анализом их структуры с помощью флуоресцентной микроскопии. Полученные результаты указывают на снижение пролиферативной активности культивируемых ММСК в условиях моделирования эффектов микрогравитации в течение 5-ти суток.
Полный текст
Об авторах
Д. А. Якубец
ФГБУН Государственный научный центр Российской Федерации – Институт медико-биологических проблем Российской академии наук
Автор, ответственный за переписку.
Email: lizard_96@mail.ru
Россия, Москва
Л. Б. Буравкова
ФГБУН Государственный научный центр Российской Федерации – Институт медико-биологических проблем Российской академии наук
Email: lizard_96@mail.ru
член-корреспондент РАН
Россия, МоскваСписок литературы
- Буравкова Л.Б. Механизмы клеточной гравичувствительности. М.: ГНЦ РФ – ИМБП РАН; 2018.
- Gershovich P., Gershovich J., Zhambalova A., et al. Cytoskeletal proteins and stem cell markers gene expression in human bone marrow mesenchymal stromal cells after different periods of simulated microgravity // Acta Astronautica. 2012. Vol. 70, P. 36–42.
- Andrews, S. (n.d.). FastQC A Quality Control tool for High Throughput Sequence Data. Доступно по: http://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/fastqc/ Ссылка активна на 25 сентября 2024.
- Krueger, F. (2021). Trim Galore. Доступно по: https://www.bioinformatics.babraham.ac.uk/projects/trim_galore/ Ссылка активна на 25 сентября 2024.
- Kim, D., Langmead, B., Salzberg, S. L. HISAT: a fast spliced aligner with low memory requirements // Nature Methods. 2015. Т. 12 №4, 357–360.
- Liao, Y., Smyth, G. K., Shi, W. featureCounts: an efficient general purpose program for assigning sequence reads to genomic features // Bioinformatics. 2013. Т. 30. № 7. 923–930.
- Love, M. I., Huber, W., & Anders, S. Moderated estimation of fold change and dispersion for RNA-seq data with DESeq2 // Genome Biology. 2014. T. 15. № 12.
- Szklarczyk, D., Kirsch, R., Koutrouli, M., et al. The STRING database in 2023: protein-protein association networks and functional enrichment analyses for any sequenced genome of interest // Nucleic acids research. 2023. T. 51, №D1, C. 638–D646.
- Gene Ontology Consortium. The Gene Ontology resource: enriching a GOld mine // Nucleic Acids Res. 2021. Т. 49, №D1. С. 325-D334.
- Li X., Huang W., Huang W., et al. Kinesin family members KIF2C/4A/10/11/14/18B/20A/23 predict poor prognosis and promote cell proliferation in hepatocellular carcinoma // Am J Transl Res. 2020. Т. 12, №5. С. 1614-1639.
- Li L., Zhang C., Chen J.L., et al. Effects of simulated microgravity on the expression profiles of RNA during osteogenic differentiation of human bone marrow mesenchymal stem cells // Cell Prolif. 2019. Т. 52, №2. С. 12539.
- Wei L., Diao Y., Qi J., et al. Effect of change in spindle structure on proliferation inhibition of osteosarcoma cells and osteoblast under simulated microgravity during incubation in rotating bioreactor // PLoS One. 2013. Т. 8, №10. С. 76710
- Tran M.T., Ho C.N.Q., Hoang S.N., et al. Morphological Changes of 3T3 Cells under Simulated Microgravity // Cells. 2024. Т. 13, № 4. С. 344.
- Ratushnyy, A.Y., & Buravkova, L.B. Microgravity Effects and Aging Physiology: Similar Changes or Common Mechanisms? // Biochemistry. Biokhimiia. 2023. Т. 88. №11. С. 1763–1777.
- Touchstone, H., Bryd, R., Loisate, S., et al. Recovery of stem cell proliferation by low intensity vibration under simulated microgravity requires LINC complex //NPJ microgravity. 2019.Т. 5, № 11.
- Sokolovskaya, A.A., Sergeeva, E.A., Metelkin, et al. The Expression of Cell Cycle Cyclins in a Human Megakaryoblast Cell Line Exposed to Simulated Microgravity // International journal of molecular sciences. 2024. Т. 25. №12. С. 6484.
- Yuge, L., Kajiume, T., Tahara, H., et al. Microgravity potentiates stem cell proliferation whilesustaining the capability of differentiation // Stem CellsDev. 2006. Т. 15, С. 921–929.
- Ho, C.N.Q., Hoang, S.N., Nguyen, H.H., et al. The adaptation of 3T3 cells to simulated microgravity by retrieving the major cell cycle-related protein expression during long-term in vitro proliferation // Tissue & cell. 2024. Т. 89. C. 102460.
- Sokolovskaya A., Ignashkova T., Bochenkova A., et al. Effects of simulated microgravity on cell cycle in human endothelial cells // Acta Astronautica. 2014. Т. 99. С. 16–23.
- Markina E., Tyrina E., Ratushnyy A., et al. Heterotypic Cell Culture from Mouse Bone Marrow under Simulated Microgravity: Lessons for Stromal Lineage Functions // International Journal of Molecular Sciences. 2023. T. 24. №18, 13746.
Дополнительные файлы
